Nanopore 16S rRNA Microbiome Analysis Pipeline
基于纳米孔测序技术,面向微生物多样性研究的专业分析平台。 从质量控制到物种鉴定,从 Alpha/Beta 多样性到差异物种挖掘, 一键生成交互式可视化报告。
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覆盖 16S 菌群研究全流程,支持单样本精细解析与多样本组间比较
自动计算 reads 数量、均值读长、Q20/Q30 比例等指标,并输出长度与质量分布图,保障下游分析数据可靠。
基于精选 16S 数据库对 ASV/reads 进行分类注释,输出门到种七级分类谱系,精确计算各分类单元相对丰度。
计算 Observed Species、Shannon 指数、Gini-Simpson 指数等核心 α 多样性指标,量化单样本菌群丰富度与均匀性。
基于 Bray-Curtis 距离构建样本间差异矩阵,结合 PCoA 降维散点图直观呈现组间聚类与分离模式。
采用 LEfSe-like 统计策略对组间菌群进行差异显著性检验,以进化枝图(Cladogram)与 LDA 柱图可视化标志物种。
所有结果整合为自包含的单文件 HTML 报告,支持数据下载(CSV/PNG),无需任何外部依赖,开箱即用。